中屯遗址位於澎湖县白沙乡中屯村，包括中屯A、B、C三处遗址地点。中屯A遗址位在中屯村永安桥南端的台地上，遗址的经纬度位置为东经119 °35' 53"，北纬23° 37' 19"，海拔高度在10公尺以下。遗址的性质为澎湖群岛历史时期遗弃的贝塚，范围约有600平方公尺。本遗址发现甚早，为台大地质学系林朝棨教授於1962年发现，1979年台湾大学人类学系的黄士强教授曾经进行考古发掘工作。之後的1983年，臧振华教授曾经进行考古调查，2000年的「台闽地区考古遗址普查研究计画─第四期」的调查研究工作，以及2002年国立历史博物馆历史考古小组的试掘工作。本遗址出土的考古遗留非常丰富，包括：中国宋元时期的陶瓷片、各式硬陶、瓦片和砖，其他尚有铁制的鱼钩；另外还有贝类和动物骨骼遗留。遗址的年代估计在距今1300到900年间。而2002年国立历史博物馆的试掘工作共出土349件史前陶和一件唐代的青瓷。此项新资料或显示遗址的文化内涵或年代有须在进一步研究和修正的可能。
中屯B遗址在中屯岛南岸中正桥北端，为1952年时任台大地质学系的林朝棨教授所发现(林朝棨1966)，但在之後的遗址复查已无法再确认正确的遗址位置，推测遗址应已遭湮灭。
中屯C遗址在往白沙乡方向，过中正桥东侧的一处通往海边产业道路尽头的北边约50公尺的海阶上。遗址的经纬度为东经119 °36' 28"，北纬23° 37' 8"，海拔高度约3公尺。为历史时代汉文化的遗址，年代约在距今1300到900年间。遗址为1983年臧振华所发现，但2000年的普查计画调查时发现，该遗址已为近代墓葬所摧毁。
参考资料
林朝棨1966 概说台湾第四纪的地史并讨论其与自然史和文化史的关系。台大考古人类学刊28：7- 44。黄士强、刘益昌1980 全省重要史蹟勘查与整修建议─考古遗址与旧社部分。交通部观光局委托，国立台湾大学人类学系执行。臧振华、叶美珍2000 台闽地区考古遗址普查硏究计划(第四期)。内政部委托，中央研究院历史语言研究所执行。国立历史博物馆历史考古小组2003 澎湖内垵．中屯历史考古研究成果报告。Tsang Cheng-hwa1992 The Archaeology of the P'eng-hu Island. Taipei: Institute of History and Philology, Academia Sinica.