1831年南投县丞朱懋延请南北投、水沙连两堡士庶议建於南投街东，1833年建成，并以生员曾作云等董其事。书院中殿供奉文昌帝君，内殿为讲堂，房居山长，後祀朱子，旁为斋舍做为地方文人士子修学之地，南投文风因而渐盛。1845年因地震雨灾而毁，18-年士绅吴联辉出资迁建，1884年其子林朝阳曾重修。日治时期1912年因市区改正再度迁建，1917年改为国语（日语）传习所南投分教场，後捐给南-学校，成为该校前身。战後军队军眷一度占住该院，年久失修，1957年地方士绅倡议重修，并将文昌祠、孔庙与济化宫并入。1971年南投蓝田书院管理委员会成立，1985年列为第-古蹟。
参考资料
〔★《重修-省通志》，1993〕