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系统生物学开始於对基因和蛋白质的研究，该研究使用高通量技术，如生物基因晶片、蛋白质体技术、二维电泳法、质谱仪法等，采取大量数据并以精确电脑运算及统计学方法来测定物种在给定条件干涉下基因组和蛋白质组的变化，以建构基因及蛋白质网路及生物功能的路径与循环，进而建立路径与循环的模型。可应用的范围包括细胞内生理调控路径的研究，研究癌症细胞生理变异以达到抗癌效果及大量且快速的药物筛检。系统生物学是一个试图整合生物系统各不同部分之间的相互关系和相互作用（例如细胞信号传导，代谢通路，生理系统与生物等相关的基因和蛋白网路）以理解生物系统如何行使功能，发展出一个整个生物系统的定量模型并整合出一套能详细解释生物机制的调节与影响。可让我们对生物系统的运作有更深的了解，并经研发而应用在疾病预防、医学诊断、治疗、药物研究等，以达到治癒人类疾病的方法。
我国在系统生物学这方面尚处於起步的阶段，目前-大学已於2006年6月成立「系统生物与生物资讯学研究中心」，期在结合国内各领域的专业知识与人才，形成一个教学与研究的团队，并於2006年12月与中研院合组一个跨领域、跨院校的研究团队，执行「计算生物学先导型研究计画」，持续保持尖端研究力和全球竞争力。
中文关键字：系统生物学
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